Le fort Desaix fait partie de l´ensemble de quatorze fortifications (onze en Alsace, trois en pays de Bade) réalisées autour de Strasbourg par le général prussien von Moltke après la chute de la ville en 1870. Ces fortifications suivent le concept développé par Hans Alexis von Biehler dont le but était de former une enceinte discontinue autour de la place forte faite de forts d’artillerie espacés d’une portée de canons. Le projet initial prévoyait la construction de trente-six forts mais, finalement, seuls quatorze forts furent construits.

Le fort s'appela initialement Fort Roon. Après la victoire française contre l'Allemagne en 1918, il fut renommé fort Desaix.

Il abrite aujourd'hui un stand de tir.

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